دانشگاه مراغه این واحد در سال 1366 با عنوان آموزشکده کشاورزی با جذب 40 نفر دانشجو در مقطع کاردانی امور زراعی آغاز به کار کرد. طی سال‌های 1370 تا 1373 اقدام به خرید زمینی به مساحت 110 هکتار جهت توسعه در منطقه‌ی گلشهر نمود.       در فاصله‌ی سال‌های 1372 تا 1374 اقدام به افزایش رشته‌های تحصیلی تا سقف 4 رشته شامل مهندسی باغبانی، گیاهپزشکی و خاک‌شناسی در مقطع کارشناسی و تکنولوژی تولیدات گیاهی در مقطع کاردانی کرد.       آموزشکده در سال 1377 از آموزشکده به دانشکده ارتقاء یافت و در بهمن 1383 با تبدیل آن به مجتمع آموزش عالی مراغه موافقت به عمل آمد و در اردیبهشت ماه 1384 موافقت قطعی آن صادر گردید.       در حال حاضر این مجتمع دارای 15 آزمایشگاه، 11 واحد کلاس درس، اتاق استادان و بخش اداری و خدماتی، نمازخانه، بخش‌های فرهنگی، مرکز کامپیوتر، کتابخانه، آشپزخانه، سلف سرویس، آمفی تئاتر، کارگاه و سوله‌ی ماشین‌آلات، مزرعه آموزشی، دو حلقه چاه، باغ و گلخانه آموزشی است.       هم اکنون در این مجتمع 44 نفر عضو هیئت علمی، 75 نفر پرسنل اداری و خدماتی و نزدیک به 920 نفر دانشجو مشغول فعالیت هستند.   رشته‌های تحصیلی در دانشگاه مراغه رشته‌های کشاورزی نام رشتهمقطعسال تأسیس مهندسی کشاورزی- علوم خاککارشناسی پیوسته1376 مهندسی کشاورزی- گیاهپزشکیکارشناسی پیوسته1375 مهندسی کشاورزی- باغبانیکارشناسی پیوسته1374 مهندسی کشاوری- زراعت و اصلاح نباتاتکارشناسی پیوسته1382 تکنولوژی تولیدات گیاهیکاردانی1366 مهندسی تولیدات گیاهی- باغبانیکارشناسی ناپیوسته1384 مهندسی تولیدات گیاهی- زارعتکارشناسی ناپیوسته1384     رشته‌های علوم پایه نام رشتهمقطعسال تأسیس ریاضی کاربردیکارشناسی پیوسته1385 شیمی کاربردیکارشناسی پیوسته     اين دانشگاه فاقد خوابگاه بوده هيچگونه تعهدي در خصوص تأمين آن ندارد.