دانشگاه علوم پزشکی ارتش ساختمان اداری دانشگاه از سال 72 در طبقات بالای بیمارستان 501 ارتش سازماندهی شد. سپس ساختمان دانشکده پزشکی بعد از پذیرش دانشجو در سال 73 تأسیس گردید. در همان سال دانشکده پیراپزشکی و پرستاری ضمیمه دانشگاه شده و به منظور گسترش محوطه و مجموعه اداری دانشگاه در سال 74 ساختمان هیات رئیسه به صورت جداگانه‌ای احداث شد. همچنین ساختمانی مجزا برای بیوتکنولوژی و سالنی مجهز به منظور گسترش دانشگاه ایجاد شد. در سال 75 بنای ساختمانی 8 طبقه برای دانشکده پزشکی و هیات رئیسه دانشگاه پایه‌گذاری شد که در سال 80 به بهره‌برداری رسید. تأسیس ساختمان پیراپزشکی در محوطه دانشگاه و انتقال آن به این مرکز از امور دیگر انجام شده می‌باشد. در همین راستا ادغام دانشکده پرستاری نیروی هواییی ارتش با دانشکده پرستاری آجا و ایجاد یک دانشگاه شنابه مجزا صورت پذیرفته است. ایجاد مراکز تحقیقاتی داخل دانشگاهی و دپارتمان طب هوا و فضا از موضوعات دیگر است که از سال 76 قوت گرفته و به امید خدا ایجاد مرکز ISP در تقویت مراکز مذکور و دانشگاه تأثیر به‌سزایی خواهد داشت.   رشته- مقطع‌های ارائه شده: مقطعرشتهدانشکده متولیاولین سال پذیرشتوضیحات تخصصطب فیزیکی و توانبخشیپزشکی1377- دکتری حرفه‌ایپزشکیپزشکی1373- کارشناسیپرستاریپرستاری1350- کاردانیعلوم آزمایشگاهیپیراپزشکی1372- کاردانیرادیولوژیپیراپزشکی1372- کاردانیاتاق عملپیراپزشکی1372- کاردانیهوشبریپیراپزشکی1372- کاردانیمدارک پزشکیپیراپزشکی1372-     بیمارستان‌های آموزشی تحت پوشش دانشگاه: ردیفبیمارستان/ مرکزسال تأسیستخت فعالرشته‌های آموزشی 1بعثت نیروی هوایی1366450داخلی، داخلی اعصاب، قلب، جراحی، جراحی مغز و اعصاب، زنان و زایمان، چشم‌پزشکی، گوش و حلق و بینی، جراحی استخوان و مفاصل، جراحی کلیه و مجاری ادراری- تناسلی، روانپزشکی، پوست و عفونی 2گلستان نیروی دریایی1352150داخلی، قلب، جراحی، جراحی استخوان و مفاصل 3خانواده1346256جراحی عمومی، جراحی مغز و اعصاب، کودکان، زنان و زایمان، جراحی استخوان و مفاصل، جراحی کلیه و مجاری ادراری- تناسلی و نوزادان 4بیمارستان 5011372185داخلی، اعصاب، روماتولوژی، خون، قلب، کلیه، جراحی عمومی، پوست و عفونی 5بیمارستان 504134660چشم‌پزشکی و گوش و حلق و بینی 6بیمارستان 502130060قلب 7بیمارستان 5051307100ریه 8بیمارستان 5061358104روانپزشکی     دانشکده پزشکی ارتش:       ساختمان اداری هیات رئیسه دانشکده پزشکی قبل از ایجاد ساختمان علوم پایه در طبقات بالایی بیمارستان 501 بوده است. این دانشکده از همان ابتدا با در اختیار داشتن 3 بیمارستان جنرال و تخصصی و فوق تخصصی بزرگ و 6 بیمارستان سانترال تخصصی و فوق تخصصی در سال اول 25 دانشجو را پذیرش کرده و به تدریج یا جذب هیات علمی بیشتر، از سال 1374 حداقل 40 دانشجو پذیرش نموده است. در سال 1373 ساختمان علوم پایه و ساختمانی مجزا برای هیات رئیسه دانشکده پزشکی تأسیس گردید. ایجاد مرکز تحقیقاتی داخلی و دپارتمان طب هوا و فضا و سایت رایانه، بزرگ‌تر نمودن کتابخانه و پذیرش مهمان از دانشگاه علوم پزشکی فاطمیه و دانشگاه‌های دیگر از امور انجام شده بوده است.   آزمایشگاه‌ها:       آسیب‌شناسی، آناتومی، بیوشیمی، بافت‌شناسی، فیزیک پزشکی، فیزیولوژی، قارچ‌شناسی و انگل‌شناسی، ایمنی‌شناسی و میکروب‌شناسی   دانشکده پرستاری ارتش:       این مرکز آموزش عالی در بدو تأسیس، با عنوان آموزشگاه عالی پرستاری و سپس مدرسه عالی پرستاری نیروی زمینی، دانشکده پرستاری نیروی زمینی و از تاریخ 1378، با عنوان دانشکده پرستاری ارتش، تحت تابعیت دانشگاه علوم پزشکی ارتش و منحصراً در زمینه آموزش رشته پرستاری فعالیت می‌نماید. .       در سال 1380 دانشکده پرستاری نیروی هوایی با این دانشکده ادغام شد و کلیه دانشجویان دانشکده پرستاری نیروی هوایی به اینجا منتقل شدند. آزمایشگاه‌ها:       در دانشکده پرستاری: فیزیولوژی، انگل‌شناسی، ایمنی‌شناسی، بیوشیمی، میکروب‌شناسی، skill lab       در دانشکده پزشکی: آناتومی