دانشگاه علوم پزشکی یزد در سال 1362 به همت سومین شهید محراب حضرت آیت‌الله صدوقی اولین دانشکده پزشکی بعد از پیروزی انقلاب اسلامی، در یزد با پذیرش 33 دانشجوی پزشکی شروع به کار نمود و در تداوم آن دانشکده‌های پرستاری در وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی به دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی شهید صدوقی یزد مبدل گردید.       دانشگاه اکنون با پذیرش دانشجو در 17 رشته تحصیلی در مقاطع مختلف کاردانی، کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکترای حرفه‌ای و همچنین 7 رشته تخصصی پزشکی و یک مقطع فلوشیپ نازائی در جهت آموزش علوم پزشکی به فعالیت خود ادامه می‌دهد.       همچنین ارائه خدمات بهداشتی درمانی را با 51 مرکز بهداشتی درمانی شهری، 41 مرکز بهداشتی درمانی روستایی، 219 خانه بهداشت و 32 پایگاه بهداشتی (علاوه بر ارائه مراقبت‌های اولیه بهداشتی)، 5 بیمارستان تخصصی و فوق تخصصی در مرکز استان و 9 بیمارستان عممی در شهرستان‌های تابعه عرضه داشته و محیط آموزشی جهت دانشجویان رشته‌های علوم پزشکی را فراهم آورده است.   رشته- مقطع‌های ارائه شده: مقطعرشتهدانشکده متولیاولین سال پذیرشتوضیحات فلوشیپنازایی و IVFپزشکی1377- دکتری تخصصیداخلیپزشکی1370- دکتری تخصصیزنان و زایمانپزشکی1367- دکتری تخصصیکودکانپزشکی1367- دکتری تخصصیگوش و حلق و بینیپزشکی1366- دکتری تخصصیجراحی عمومیپزشکی1368- دکتری تخصصیچشم‌پزشکیپزشکی1367- دکتری تخصصیبیهوشیپزشکی1370- دکتری تخصصیپرتوشناسی تشخیصیپزشکی1367- دکتری تخصصیجراحی استخوان و مفاصلپزشکی1372- دکتری حرفه‌ایپزشکیپزشکی1362- دکتری حرفه‌ایدندانپزشکیدندانپزشکی1371- کارشناسی ارشدبیوشیمیپزشکی1380- کارشناسیپرستاریپرستاری و مامایی1365- کارشناسیماماییپرستاری و مامایی1366- کارشناسیبهداشت عمومیبهداشت1368- کارشناسی ناپیوستهپرستاریپرستاری و مامایی1364- کارشناسی ناپیوستهماماییپرستاری و مامایی1364- کارشناسی ناپیوستهعلوم آزمایشگاهیپیراپزشکی1370- کاردانیعلوم آزمایشگاهیپیراپزشکی1370- کاردانیرادیولوژیپیراپزشکی1367- کاردانیاتاق عملپیراپزشکی1369- کاردانیپرستاریپرستاری و مامایی1364- کاردانیماماییپرستاری و مامایی1364- کاردانیمبارزه با بیماری‌هابهداشت1366- کاردانیبهداشت خانوادهبهداشت1366- کاردانیبهداشت محیطبهداشت1370- کاردانیهوشبریپیراپزشکی1366- کاردانیبهداشت حرفه‌ایبهداشت1371-       بیمارستان‌های آموزشی تحت پوشش دانشگاه: ردیفبیمارستان/ مرکزسال تأسیستخت فعالرشته‌های آموزشی 1شهید صدوقی1381275داخلی، داخلی اعصاب، جراحی، کودکان و نوزادان، زنان و زایمان، چشم‌پزشکی، گوش و حلق و بینی و عفونی 2شهید رهنمون1326200جراحی، قلب، جراحی مغز و اعصاب، جراحی استخوان و مفاصل، جراحی کلیه و مجاری ادراری- تناسلی 3افشار1360111قلب و جراحی استخوان و مفاصل 4سوانح سوختگی شهید صدوقی135640پوست و سوختگی 5مرکز جامع روانپزشکی136693روانپزشکی     دانشکده پزشکی       این دانشکده به دنبال تأسیس دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی شهید صدوقی یزد از سال 1364 هجری شمسی فعالیت خود را در زمینه تعلیم و تربیت نیروهای کاردانی در رشته‌های تحصیلی علوم آزمایشگاهی، اتاق عمل، هوشبری و رادیولوژی آغاز نموده است و در حال حاضر علاوه بر مقاطع و رشته‌های فوق‌الذکر در رشته‌ی علوم آزمایشگاهی مقطع کارشناسی نیز دایر می‌باشد.         گروه‌های آموزشی: علوم آزمایشگاهی، هوشبری و اتاق عمل، رادیولوژی، عمومی   آزمایشگاه‌ها:       ü تحقیقاتی و بیوتکنولوژی       ü هماتولوژی و بانک خون       ü میکوب‌شناسی       ü قارچ‌شناسی و انگل‌شناسی       ü فیزیک و بیوفیزیک       ü فیزیولوژی و ایمنولوژی و بافت‌شناسی       ü شیمی و بیوشمی   دانشکده پرستاری و مامایی       این دانشکده به عنوان یکی از اولین دانشکده‌های دانشگاه علوم پزشکی شهید صدوقی در سال 1364 با پذیرش دانشجویان پرستاری مامایی در مقاطع تحصیلی کاردانی، کارشناسی ناپیوسته و کارشناسی پیوسته فعالیت خود را با هدف ارائه خدمات آموزشی مناسب و تربیت نیروی انسانی کارآمد جهت ارتقاء سطح سلامت جامعه آغاز نموده است که در این راستا تا کنون بالغ بر 1495 نفر پرستار و ماما از این دانشکده فارغ‌التحصیل شده‌اند و فعالیت آموزشی دانشکده با پذیرش سالانه 20 دانشجو در رشته کارشناسی پرستاری و 15 دانشجو در رشته مامایی تداوم دارد.   گروه‌های آموزشی:       - گروه پرستاری       - گروه مامایی   آزمایشگاه‌ها:       در دانشکده پرستاری و مامایی: skill lab       در دانشکده پزشکی: آناتومی       در دانشکده پیراپزشکی: بیوشیمی، فیزیولوژی، انگل‌شناسی، میکروب‌شناسی، بافت‌شناسی و سلول‌شناسی، فیزیک پزشکی، آزمایشات کاربردی، ایمنی‌شناسی   دانشکده بهداشت       دانشکده بهداشت یکی از شش دانشکده دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی شهید صدوقی یزد می‌باشد که در سال 1368 با مساحتی حدود 1600 متر مربع در دو طبقه تأسیس و با پذیرش 25 نفر دانشجو در رشته کارشناسی ناپیوسته بهداشت عمومی از ابتدای مهر ماه سال 1369 کار آموزشی خود را شروع نمود. البته قبل از تاریخ فوق دو رشته کاردانی بهداشت خانواده و مبارزه با بیماری‌ها در گروه‌های بهداشت و مبارزه با بیماری‌های دانشکده پیراپزشکی مشغول تحصیل بودند که با تأسیس دانشکده گروه‌های مذکور به همراه دانشجویان مربوط به دانشکده بهداشت منتقل گردیدند.       در سال 1370 مجوز تأسیس و راه‌اندازی کاردانی بهداشت محیط با پذیرش 25 نفر دانشجو اخذ گردید.       در سال 1371 مجوز تأسیس و راه‌اندازی کاردانی بهداشت حرفه‌ای با پذیرش 25 نفر دانشجو اخذ گردید.       در سال 1373 مجوز تأسیس و راه‌اندازی کارشناسی ناپیوسته بهداشت محیط با پذیرش 25 نفر دانشجو اخذ گردید.       در سال 1382 مجوز تأسیس و راه‌اندازی کارشناسی ناپیوسته بهداشت حرفه‌ای با پذیرش 28 نفر دانشجو اخذ گردید.       در سال 1382 مجوز تأسیس و راه‌اندازی کارشناسی پیوسته مدیریت خدمات بهداشتی درمانی با پذیرش 23 نفر دانشجو اخذ گردید.       این دانشکده در حال حاضر با مساحتی خدود 7600 متر مربع دارای 9 کلاس اختصاصی می‌باشد و در صورت نیاز بیشتر، از کلاس‌های دانشکده‌های مجاور استفاده می‌نماید.       دانشکده به طور متوسط در دو نیمسال تحصیلی عداد 250 نفر دانشجو در مقاطع کاردانی، کارشناسی و کارشناسی ارشد پذیرش می‌نماید.   گروه‌های آموزشی:       گروه آمار حیاتی       گروه بهداشت محیط       گروه بهداشت حرفه‌ای       گروه خدمات بهداشتی       گروه مبارزه با بیماری‌ها       گروه مدیریت خدمات بهداشتی درمانی مقاطع و رشته‌های تحصیلی موجود دانشکده:       - کارشناسی ناپیوسته بهداشت محیط       - کارشناسی ناپیوسته بهداشت عمومی       - کارشناسی ناپیوسته بهداشت حرفه‌ای       - کارشناسی پیوسته مدیریت خدمات بهداشتی درمانی       - کاردانی بهداشت محیط       - کاردانی بهداشت حرفه‌ای       - کاردانی بهداشت عمومی با گرایش بهداشت خانواده       - کاردانی بهداشت عمومی با گرایش مبارزه با بیماری‌ها       - کارشناسی ارشد ناپیوسته آموزش بهداشت   دانشکده دندان‌پزشکی       دانشکده دندان‌پزشکی یزد در سال 1372 با ریاست دکرت احمد حائریان راه‌اندازی و با پذیرش 26 نفر دانشجوی دندان‌پزشکی شروع به فعالیت نمود. این دانشکده در زمینی به وسعت 60000 متر مریع و زیر بنای 14 هزار متر مربع که شامل سه بخش اداری، آموزشی و درمانی و نمازخانه، آمفی تئاتر، سلف سرویس، کتابخانه و مهد کودک می‌باشد. در حال حاضر تعداد دانشجویان مشغول به تحصیل 130 نفر بوده که تا کنون تعداد 198 نفر فارغ‌التحصیل گردیده‌اند که تعداد 9 نفر از آن‌ها به دوره‌های تخصصی راه یافته‌اند. هم اکنون ریاست این دانشکده بر عهده دکتر محمدرضا طالبی اردکانی می‌باشد.   گروه‌های آموزشی:       گروه پاتولوژی رادیولوژی و بیماری‌های دهان و تشخیص       گروه پریودانتیکس       گروه جراحی فک و دهان و صورت       گروه ارتودنسی       گروه اطفال       گروه اندودانتیکس       گروه ترمیمی       گروه پروتزهای دندانی   آزمایشگاه‌ها:       آزمایشگاه‌های دارای فضای فیزیکی مستقل: آسیب‌شناسی دهان و فک       لابراتوارهای دارای فضای فیزیکی مستقل: لابراتوار آناتومی، فانتوم ترمیمی، فانتوم پروتز ثابت و فانتوم اندودنتیکس، لابراتوار پروتز دندانی متحرک و ثابت، لابراتوار دندان‌پزشکی کودکان، لابراتوار دندان‌پزشکی پریودنتیکس، فانتوم پروتز پارسیل و کامل، لابراتوار ارتودنتیکس   دانشکده پزشکی       دانشکده پزشکی شهید صدوقی در سال 1362 تأسیس شد و دارای مساحت 150000 متر مربع و زیر بنا 10372 متر مربع می‌باشد و جهت تربیت پزشک عمومی انجام وظیفه می‌نماید که دوره آن هفت سال می‌باشد همچنین دارای دوره فوق لیسانس در بیوشیمی می‌باشد. دارای 148 نفر عضو هیئت علمی، یک نفر استاد، هفت نفر دانشیار، 127 نفر استادیار، 23 نفر مربی می‌باشد.       و در گروه‌های داخلی- اطفال، ارتوپدی، گوش و حلق و بینی، و زنان و زایمان و بیهوشی به تربیت دستیار (رزیدنت) اشتغال دارند و 515 نفر دانشجو در رشته پزشک عمومی، چهار نفر در دوره فوق لیسانس بیوشیمی و 36 نفر در دوره‌های دستیاری تخصصی دانشکده مشغول به تحصیل می‌باشند.   آزمایشگاه‌ها:       آناتومی، ایمنی‌شناسی، بیوشیمی، فیزیولوژی، فیزیک پزشکی، ویروس‌شناسی، بافت‌شناسی، آسیب‌شناسی، میکروب‌شناسی، قارچ‌شناسی و انگل‌شناسی         گروه‌های آموزشی:       الف- گروه‌های آموزشی واحد علوم پایه:       1- گروه مرفو آناتومی       2- گروه فیزیک پزشکی       3- گروه پاتولوژی       4- گروه فارماکولوژی       5- گروه پاتوبیولوژی       6- گروه بیوشیمی       7- گروه فیزیولوژی       8- گروه عمومی       9- گروه معارف اسلامی         ب- گروه‌های آموزشی واحد علوم بالینی:       1- گروه جراحی       2- گروه داخلی       3- گروه قلب       4- گروه گوش و حلق و بینی       5- گروه ارولوژی       6- ارتوپدی       7- گروه بیماری‌های پوست       8- گروه بیماری‌های کودکان       9- گروه بیماری‌های عفونی       10- گروه هوشبری       11- گروه روانپزشکی       12- گروه چشم       13- گروه بیماری‌های اعصاب       14- گروه زنان و زایمان       15- گروه پزشکی اجتماعی       16- گروه رادیولوژی